Bộ phim là phiên bản chỉnh sửa của ba bộ phim ngắn khác nhau của Nhật Bản, được kết hợp lại với nhau. Có lời tường thuật của một nhân vật tiếp tục, Kari. Phân đoạn đầu tiên của bộ phim xoay quanh cuộc chạm trán đầu tiên với một Digimon và cuộc chiến xảy ra giữa Digimon của họ và một Digimon khác. Hai đứa trẻ, Kari và Tai, nuôi dạy một Digimon đang phát triển nhanh chóng từ một quả trứng thành một Digimon lớn giống khủng long, nó trốn thoát khỏi nhà của họ và sau đó chạm trán và chiến đấu với một Digimon giống vẹt. Phân đoạn thứ hai chủ yếu liên quan đến Tai và một người bạn digiDestined khác của anh ấy, Izzy. Một loại vi-rút máy tính quét qua internet, ảnh hưởng đến một digiEgg và do đó tạo ra một digimon bị nhiễm. Digimon bị nhiễm bệnh này bắt đầu ăn thông tin và dữ liệu máy tính, và hai nhân vật chính cố gắng ngăn chặn Digimon nhưng không thành công. Sau khi Digimon bị nhiễm tìm cách xâm nhập vào hệ thống thông tin của Mỹ và phóng hai quả bom hạt nhân, một ở Nhật Bản và một ở Colorado, Tai và Izzy nhận được sự giúp đỡ từ đồng đội Matt và em trai TK. Họ đã vượt qua thành công Digimon bị nhiễm và ngăn không cho hạt nhân phát nổ. . Phân đoạn thứ ba và cũng là phân đoạn cuối cùng liên quan đến Kari và TK, giờ đã nhiều tuổi hơn, khi họ nhìn thấy một đứa trẻ và hai Digimon đánh nhau khi ở New York. Kari và TK quyết định đi theo đứa trẻ, người hóa ra là người tạo ra virus, và sau khi gặp gỡ bạn bè, họ đã đánh bại được con quái vật độc ác, kẻ hóa ra là một trong những con quái vật song sinh của Willis đã bị ảnh hưởng bởi virus sau các hành động của phân đoạn thứ hai. Họ cùng nhau chiến đấu chống lại Digimon bị nhiễm bệnh này và tiêu diệt loại virus đang ảnh hưởng đến Digimon của Willis.
